La historia tiene lugar en el futuro de la Tierra. Los humanos lograron sobrevivir al holocausto, conocido como los Siete Días de Fuego. Sin embargo,mil años después, la mayor parte de la superficie de la tierra se encontraba cubierta por la jungla tóxica, una densa zona forestal protegida por los Ohmu, animales monstruosos con forma de insecto. En esa zona mortal el aire afecta a los pulmones humanos, por tanto, es ndispensable el uso de mascarillas.
Hubieron múltiples intentos para incendiar estos bosques tan nocivos, pero siempre aparecieron los Ohmus para impedirlo. Cerca de una de estas junglas, había un pequeño reino llamado el Valle del Viento, donde vivía un rey, junto a su hija Nausicaa. el pueblo no era rico pero si activo y alegre. Cierto día, el ejército de de tormequia invadió el reino, y Nausicaa no tuvo más remedio que participar en la guerra. Los enemigos también pretenden acabar con la jungla tóxica y los insectos que moran en ella de una vez por todas.
Pero Nausicaa sabía que era allí precisamente donde se purificaba el aire contaminado de la Tierra. La chica busca el camino de la convivencia entre los humanos y seres de la naturaleza. Su esfuerzo la obliga a arriesgar la vida en múltiples ocasiones, y la historia se desarrollahasta alcanzar un desenlace digno de todo título de Ghibli.